Publications

Journal of Japanese Biochemical Society 94, 6, 868-874 (2022)
Comprehensive analysis of alternative splicing coupled with nonsense-mediated mRNA decay (AS-NMD) in C. elegans

Author

Hidehito Kuroyanagi

Category

Review Articles

Abstract

筆者らは,線虫のナンセンスコドン介在的mRNA分解(NMD)欠損変異株を利用して,全長mRNAの直接シーケンシング解析により,NMDの基質となるスプライスバリアントの網羅的探索を行い,259遺伝子の289バリアントを同定した.このうち,S-アデノシル-L-メチオニン(SAM)合成酵素をコードするsams遺伝子群では,SAMの濃度に応じて3′スプライス部位のAGジヌクレオチドのアデニン塩基がN6-メチルアデノシン(m6A)修飾を受けることで発現量が間接的にフィードバック制御されるという新奇の制御機構の発見に至った.本稿では,直接RNAシーケンシング解析を利用したmRNA全長配列解析やsams遺伝子の発現量の選択的スプライシングによる制御の意義などについて概説する.